Если при переходе через ISPManager 5 в базу через phpmyadmin идет редирект с добавлением 80 порта вида:

https://site.com:80/phpmyadmin/ 

, то проблема решается через конфиг phpmyadmin - /etc/phpMyAdmin/config.inc.php, а именно нужно добавить в него переменную:

$cfg['PmaAbsoluteUri'] = 'https://'.$_SERVER['SERVER_NAME'].'/phpmyadmin/';

После этого перезагружаем apache:

 systemctl restart httpd 

и проверяем переход через ISPManager --> Базы данных --> Нажимаем на БД --> GO